MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anabaena sp. 90 plasmid pANA03

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019440	GGA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079805
2	NC_019440	CAA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079805
3	NC_019440	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079806
4	NC_019440	TAC	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079807
5	NC_019440	GTT	2	6	814	819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079807
6	NC_019440	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079807
7	NC_019440	TGTA	2	8	1514	1521	25 %	50 %	25 %	0 %	414079808
8	NC_019440	TGA	2	6	1915	1920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079809
9	NC_019440	A	6	6	1922	1927	100 %	0 %	0 %	0 %	414079809
10	NC_019440	CATA	2	8	1984	1991	50 %	25 %	0 %	25 %	414079809
11	NC_019440	GCA	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079809
12	NC_019440	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079809
13	NC_019440	A	8	8	2109	2116	100 %	0 %	0 %	0 %	414079810
14	NC_019440	TA	3	6	2207	2212	50 %	50 %	0 %	0 %	414079810
15	NC_019440	CTA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079810
16	NC_019440	GTA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079810
17	NC_019440	TCAA	2	8	2240	2247	50 %	25 %	0 %	25 %	414079810
18	NC_019440	T	7	7	2249	2255	0 %	100 %	0 %	0 %	414079810
19	NC_019440	AAGA	2	8	2305	2312	75 %	0 %	25 %	0 %	414079811
20	NC_019440	ATT	2	6	2409	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079811
21	NC_019440	AAC	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
22	NC_019440	G	6	6	2528	2533	0 %	0 %	100 %	0 %	414079812
23	NC_019440	AT	3	6	2550	2555	50 %	50 %	0 %	0 %	414079812
24	NC_019440	CAG	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
25	NC_019440	T	6	6	2699	2704	0 %	100 %	0 %	0 %	414079812
26	NC_019440	TTA	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079812
27	NC_019440	CAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
28	NC_019440	AAT	2	6	2979	2984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
29	NC_019440	A	7	7	2997	3003	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
30	NC_019440	AC	3	6	3005	3010	50 %	0 %	0 %	50 %	414079812
31	NC_019440	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414079812
32	NC_019440	CAG	2	6	3044	3049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
33	NC_019440	ATC	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
34	NC_019440	GTA	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
35	NC_019440	TGA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
36	NC_019440	C	7	7	3287	3293	0 %	0 %	0 %	100 %	414079812
37	NC_019440	ATT	2	6	3316	3321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079812
38	NC_019440	AGCA	2	8	3330	3337	50 %	0 %	25 %	25 %	414079812
39	NC_019440	GAT	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
40	NC_019440	CAA	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
41	NC_019440	CAAAA	2	10	3437	3446	80 %	0 %	0 %	20 %	414079812
42	NC_019440	AACTA	2	10	3471	3480	60 %	20 %	0 %	20 %	414079812
43	NC_019440	GA	3	6	3600	3605	50 %	0 %	50 %	0 %	414079812
44	NC_019440	TCA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
45	NC_019440	AGGAAC	2	12	3632	3643	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414079812
46	NC_019440	A	6	6	3649	3654	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
47	NC_019440	A	6	6	3662	3667	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
48	NC_019440	A	7	7	3694	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
49	NC_019440	T	6	6	3720	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	414079812
50	NC_019440	GGA	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
51	NC_019440	AGC	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
52	NC_019440	CAA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
53	NC_019440	GGA	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
54	NC_019440	AG	3	6	3988	3993	50 %	0 %	50 %	0 %	414079812
55	NC_019440	A	6	6	4042	4047	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
56	NC_019440	ACA	2	6	4058	4063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
57	NC_019440	GAT	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
58	NC_019440	GGA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
59	NC_019440	TAA	2	6	4323	4328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
60	NC_019440	TTC	2	6	4364	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079812
61	NC_019440	TGA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
62	NC_019440	GGT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079812
63	NC_019440	TTTG	2	8	4452	4459	0 %	75 %	25 %	0 %	414079812
64	NC_019440	TA	4	8	4508	4515	50 %	50 %	0 %	0 %	414079812
65	NC_019440	A	7	7	4563	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
66	NC_019440	GAC	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
67	NC_019440	AAT	2	6	4606	4611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
68	NC_019440	GAT	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
69	NC_019440	CTA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
70	NC_019440	A	6	6	4826	4831	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
71	NC_019440	ACT	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
72	NC_019440	TAGA	2	8	4865	4872	50 %	25 %	25 %	0 %	414079812
73	NC_019440	AAG	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
74	NC_019440	AAG	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
75	NC_019440	CTG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079812
76	NC_019440	AAG	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
77	NC_019440	GGA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
78	NC_019440	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
79	NC_019440	TTG	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
80	NC_019440	A	8	8	5057	5064	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
81	NC_019440	AC	3	6	5069	5074	50 %	0 %	0 %	50 %	414079812
82	NC_019440	A	7	7	5111	5117	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
83	NC_019440	TTG	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
84	NC_019440	TTG	2	6	5143	5148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
85	NC_019440	GACCC	2	10	5227	5236	20 %	0 %	20 %	60 %	414079812
86	NC_019440	CAA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
87	NC_019440	CAA	2	6	5378	5383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
88	NC_019440	T	6	6	5451	5456	0 %	100 %	0 %	0 %	414079812
89	NC_019440	CAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
90	NC_019440	CAA	2	6	5476	5481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
91	NC_019440	CAA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
92	NC_019440	CAA	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
93	NC_019440	TAA	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
94	NC_019440	A	7	7	5643	5649	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
95	NC_019440	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079812
96	NC_019440	G	6	6	5673	5678	0 %	0 %	100 %	0 %	414079812
97	NC_019440	TGA	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
98	NC_019440	GTT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
99	NC_019440	A	7	7	5946	5952	100 %	0 %	0 %	0 %	414079813
100	NC_019440	ACA	2	6	5988	5993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
101	NC_019440	GCTCAA	2	12	6013	6024	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414079813
102	NC_019440	A	6	6	6104	6109	100 %	0 %	0 %	0 %	414079813
103	NC_019440	AGC	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079813
104	NC_019440	GCT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079813
105	NC_019440	TGC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079813
106	NC_019440	A	6	6	6358	6363	100 %	0 %	0 %	0 %	414079813
107	NC_019440	AAC	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
108	NC_019440	AAC	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
109	NC_019440	GGA	2	6	6444	6449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079813
110	NC_019440	GA	3	6	6481	6486	50 %	0 %	50 %	0 %	414079813
111	NC_019440	CAG	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079813
112	NC_019440	GAAAG	2	10	6555	6564	60 %	0 %	40 %	0 %	414079813
113	NC_019440	AATG	2	8	6571	6578	50 %	25 %	25 %	0 %	414079813
114	NC_019440	AGG	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079814
115	NC_019440	GTT	2	6	7280	7285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079814
116	NC_019440	GTT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079814
117	NC_019440	CAG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079814
118	NC_019440	TTG	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079815
119	NC_019440	TAC	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079815
120	NC_019440	AAT	2	6	7830	7835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079815
121	NC_019440	TAA	2	6	7843	7848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079815
122	NC_019440	AAG	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
123	NC_019440	TA	3	6	8456	8461	50 %	50 %	0 %	0 %	414079816
124	NC_019440	A	6	6	8495	8500	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
125	NC_019440	TCA	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
126	NC_019440	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
127	NC_019440	A	6	6	8520	8525	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
128	NC_019440	A	7	7	8573	8579	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
129	NC_019440	AAAT	2	8	8599	8606	75 %	25 %	0 %	0 %	414079816
130	NC_019440	A	6	6	8634	8639	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
131	NC_019440	TGTT	2	8	8644	8651	0 %	75 %	25 %	0 %	414079816
132	NC_019440	CAC	3	9	8671	8679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079816
133	NC_019440	A	7	7	8724	8730	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
134	NC_019440	GAAG	2	8	8896	8903	50 %	0 %	50 %	0 %	414079816
135	NC_019440	A	6	6	8907	8912	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
136	NC_019440	T	6	6	8955	8960	0 %	100 %	0 %	0 %	414079816
137	NC_019440	TACA	2	8	9036	9043	50 %	25 %	0 %	25 %	414079816
138	NC_019440	TC	3	6	9070	9075	0 %	50 %	0 %	50 %	414079816
139	NC_019440	AGC	3	9	9089	9097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
140	NC_019440	AGC	2	6	9242	9247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
141	NC_019440	TTACAA	2	12	9273	9284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414079816
142	NC_019440	TGA	2	6	9356	9361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
143	NC_019440	TGA	2	6	9407	9412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
144	NC_019440	TTAC	2	8	9413	9420	25 %	50 %	0 %	25 %	414079816
145	NC_019440	TGA	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
146	NC_019440	GCA	2	6	9462	9467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
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148	NC_019440	TCG	2	6	9536	9541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079816
149	NC_019440	ACT	2	6	9571	9576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
150	NC_019440	ATA	2	6	9622	9627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079816
151	NC_019440	TGG	2	6	9654	9659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079816
152	NC_019440	ATG	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
153	NC_019440	T	6	6	9856	9861	0 %	100 %	0 %	0 %	414079816
154	NC_019440	GAA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
155	NC_019440	AGAT	2	8	9944	9951	50 %	25 %	25 %	0 %	414079816
156	NC_019440	ATAG	2	8	9954	9961	50 %	25 %	25 %	0 %	414079816
157	NC_019440	AGT	2	6	9971	9976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
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159	NC_019440	AGA	2	6	10019	10024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
160	NC_019440	ATT	2	6	10035	10040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079816
161	NC_019440	TG	3	6	10053	10058	0 %	50 %	50 %	0 %	414079816
162	NC_019440	GAA	2	6	10068	10073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
163	NC_019440	GAA	2	6	10137	10142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
164	NC_019440	CAT	2	6	10244	10249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
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166	NC_019440	TGA	2	6	10343	10348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
167	NC_019440	TTC	2	6	10410	10415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079816
168	NC_019440	TAAAT	2	10	10427	10436	60 %	40 %	0 %	0 %	414079816
169	NC_019440	TTG	2	6	10468	10473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079816
170	NC_019440	TAA	2	6	10481	10486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079816
171	NC_019440	ATT	2	6	10594	10599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079816
172	NC_019440	A	6	6	10659	10664	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
173	NC_019440	GTA	2	6	10665	10670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
174	NC_019440	A	6	6	10682	10687	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
175	NC_019440	T	6	6	10754	10759	0 %	100 %	0 %	0 %	414079816
176	NC_019440	GAA	2	6	10785	10790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
177	NC_019440	A	7	7	10793	10799	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
178	NC_019440	CA	3	6	10819	10824	50 %	0 %	0 %	50 %	414079816
179	NC_019440	GTT	2	6	10876	10881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079816
180	NC_019440	GTA	2	6	10941	10946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
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182	NC_019440	TTTAT	2	10	10961	10970	20 %	80 %	0 %	0 %	414079816
183	NC_019440	TTTA	2	8	10997	11004	25 %	75 %	0 %	0 %	414079816
184	NC_019440	TCA	2	6	11025	11030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
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186	NC_019440	CAG	2	6	11251	11256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
187	NC_019440	CAA	2	6	11271	11276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079816
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191	NC_019440	GAC	2	6	11780	11785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079817
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251	NC_019440	TTTA	2	8	16277	16284	25 %	75 %	0 %	0 %	414079822
252	NC_019440	GTT	2	6	16322	16327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079822
253	NC_019440	TGA	2	6	16365	16370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079822
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255	NC_019440	GCT	2	6	16441	16446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079822
256	NC_019440	AAAT	2	8	16517	16524	75 %	25 %	0 %	0 %	414079822
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258	NC_019440	GGT	2	6	16695	16700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079822
259	NC_019440	TCA	2	6	16725	16730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079822
260	NC_019440	AAT	2	6	16731	16736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079822
261	NC_019440	TACC	2	8	16891	16898	25 %	25 %	0 %	50 %	414079822
262	NC_019440	TTG	2	6	16931	16936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079822
263	NC_019440	ATT	3	9	17156	17164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079823
264	NC_019440	ACT	2	6	17264	17269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079823
265	NC_019440	CAC	2	6	17356	17361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079823
266	NC_019440	TAC	2	6	17480	17485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079823
267	NC_019440	GAA	2	6	17490	17495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079823
268	NC_019440	AAT	2	6	17501	17506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079823
269	NC_019440	AAC	2	6	17532	17537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079823
270	NC_019440	GA	3	6	17543	17548	50 %	0 %	50 %	0 %	414079823
271	NC_019440	ATG	2	6	17551	17556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079823
272	NC_019440	ATA	2	6	17575	17580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079823
273	NC_019440	CTAT	2	8	17586	17593	25 %	50 %	0 %	25 %	414079823
274	NC_019440	TTC	2	6	17675	17680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079823
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277	NC_019440	GT	3	6	17846	17851	0 %	50 %	50 %	0 %	414079824
278	NC_019440	TCA	2	6	17935	17940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079824
279	NC_019440	TTG	2	6	17991	17996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079824
280	NC_019440	TGT	2	6	18133	18138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079824
281	NC_019440	AGC	2	6	18156	18161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079824
282	NC_019440	TAA	2	6	18195	18200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079824
283	NC_019440	CAG	2	6	18206	18211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079824
284	NC_019440	GCT	3	9	18325	18333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079824
285	NC_019440	T	6	6	18382	18387	0 %	100 %	0 %	0 %	414079824
286	NC_019440	AGT	2	6	18403	18408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079824
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293	NC_019440	ATC	2	6	18879	18884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079825
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297	NC_019440	CTAT	2	8	19048	19055	25 %	50 %	0 %	25 %	414079825
298	NC_019440	CAC	2	6	19169	19174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079825
299	NC_019440	GCT	2	6	19179	19184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079825
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301	NC_019440	CGT	2	6	19220	19225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079825
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311	NC_019440	CAT	2	6	19784	19789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079826
312	NC_019440	ATAG	2	8	19815	19822	50 %	25 %	25 %	0 %	414079826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.